Project 466933

Des mutations fréquentes de cellules cancéreuses touchent les complexes protéiques mSWI/SNF. Ces assemblages de protéines sont essentiels à l’initiation du cancer du foie, car ils régulent l’utilisation et la structure du matériel génétique, l’ADN. Leurs protéines interagissent directement avec l’ADN et décodent ses signaux. Le domaine de lecture le plus important dans ce processus est le bromodomaine (BRD). Comme les complexes mSWI/SNF possèdent la plus forte densité de BRD chez l’humain, les BRD seraient des acteurs centraux à leurs fonctions.Le laboratoire du Dr Lambert suppose que les BRD sont essentiels à l'activité des complexes mSWI/SNF. Un large objectif est de définir comment les BRD contribuent aux fonctions de ces complexes en examinant leurs associations avec les protéines affectant l’ADN. Ce projet vise la mise en place d’un modèle cellulaire faisant varier des signaux affectant le matériel génétique pour permettre la caractérisation d’associations potentiellement BRD-dépendantes susceptibles de contribuer au cancer du foie.Supprimer les gènes ACLY et ACOT12 de cellules hépatiques modulera les niveaux du métabolite clé acétyl-CoA pour quantifier et identifier des sites spécifiques des protéines affectant l’ADN. Les marques les plus modulées et les complexes seront localisés sur le génome pour définir si les BRD des complexes peuvent lire ces sites. Tester l’expression des gènes dont la variation des signaux affecte le plus la localisation des complexes déterminera si l’utilisation de l’ADN est altérée.Ce projet favorisera la compréhension des mécanismes sous-jacents aux fonctions des BRD dans les complexes mSWI/SNF et leurs impacts dans le cancer du foie. À plus long terme, il permettra d’explorer les interventions nutritionnelles pour traiter ce cancer.